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简书作者:生信start_site

Linux 学习笔记

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本文转载于网络, 原文地址:如何通俗地理解Family-wise error rate(FWER)和False discovery rate(FDR)

如何通俗地理解Family-wise error rate(FWER)和False discovery rate(FDR)

Family-wise error rate (FWER),暂时还不了解比较通俗易懂的翻译。False discovery rate(FDR),一般翻译为错误发现率。在研究使用假设检验解决机器学习中的分类问题时,我遇到了多重假设检验问题。FWER 和 FDR 正是解决这一问题的两种方法。经过老师和师兄师姐的指导,我能够将 FDR 应用于自己的问题当中,并且实验结果也有所改善。但是,应用之后,我仍然存在一些困惑,比如 FWER 和 FDR 到底是什么,FWER 和 FDR 怎么计算,为什么 FWER 和 FDR 能够降低错误率以及如何通俗地理解二者。

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生信常用文件格式

序列格式

  • fasta

    • 一种基于文本的、用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。在这种格式中碱基对或氨基酸用单个字母来表示,且允许在序列前添加序列名及注释,文件名常以.fasta.fa结尾。

      常见后缀说明:
      .fasta:普通的FASTA文件 (包括:.fas、 .fasta、.fsa、.fst、.txt和.fa等)
      .fna:表示核酸序列的 FASTA 文件
      .faa:表示氨基酸序列的 FASTA 文件
      .ffn:整个基因组编码区的 FASTA 文件
      .frn:以 DNA 字母编码表示的基因组非编码 RNA 区 ( 如tRNA、rRNA ) 的 FASTA 文件

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